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蛋白质元胞自动机图的构建及其应用研究
成果信息
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  • 公布年份:
    2011
  • 中图分类:
    一般性问题
  • 关键词:
  • 成果简介:
    本成果属于生物信息学领域。主要研究成果如下:1)建立了符合氨基酸物理化学特性的数字编码模型,此编码模型能将氨基酸字符序列转换成0、1数字信号,测试证明此编码模型与其他模型相比能提高蛋白质功能与结构类型预测的成功率。2)建立了基于元胞自动机的蛋白质可视化模型,我们发现第84号规则所生成的蛋白质序列图像有明显的特征,在精确性分析序列时容易发现序列的特征片段。3)研究了蛋白质序列自动分类技术。基于所建立的蛋白质可视化分析模型所得出的图像,利用图像模式识别技术,如图像复杂度、图像几何距、图像灰度矩阵等参数,建立蛋白质序列特征与功能之间的映射关系,预测了蛋白质亚细胞定位、二级结构类型、四级结构类型等,此方法与现有方法比较预测成功率达到世界领先。4)利用元胞自动机对病毒动力学进行了研究,建立了乙肝病毒动力学仿真模型。所建立的模型简单但真实的反应了乙肝病毒感染与人体免疫能力的关系。5)蛋白质元胞自动机图在生物药物发现中的应用研究。目前许多畅销的处方药物的工作原理都是通过GPCR来起作用的。我们基于蛋白质元胞自动机图开发了GPCR类型预测器,预测结果比其他方法大大提高。
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