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1.目录药物设计中分子对接优化设计的算法和软件研究

thesis_Y665728

[博士论文]李纯莲计算机应用技术大连理工大学2004

摘要：正是围绕这一方向开展.首先综述了药物设计中分子对接方法的研究现状.在深入研究分子对接理论的基础上,发展了一种基于信息熵的分子对接设计多种群演化模型,该模型除包括传统对接模型的优化目标外,还含有由信息熵组成的目标函数.除此之外,还以空间收缩尺度作为停机判据,有效地控制了算法的收敛.经典例题的数值测试表明该算法快速有效,药物分子对接实例也验证了所建立的对接模型对药物分子设计的有效性.对上述模型进行了并行

计算机辅助药物分子设计分子对接虚拟筛选遗传算法信息熵

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2.分子对接技术在昆虫化学感受研究中的应用进展

periodical_zwbh201905024

[期刊论文]李敏郭美琪相伟芳等-《植物保护》北大核心CSTPCD2019年5期

摘要：技术手段,从而有利于研究开发昆虫抑制剂,用于农林病虫害的防治.本文综述了分子对接技术在昆虫化学感受研究中的应用进展,并详细介绍了分子对接的相关软件,举例说明了分子对接的过程,可为该领域的相关研究提供理论支持和方法指导.

分子对接昆虫化学感受基因化学信息素配体复合物

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被引：12下载：66

3.蒙药广枣治疗心血管疾病药理活性研究进展及分子对接研究

periodical_ytctyy202107052

[期刊论文]黄雨佳佟海英黄先菊等-《亚太传统医药》2021年7期

摘要：广枣为蒙医习用药材,在临床上主要用于心血管疾病的治疗,其化学成分以黄酮类、有机酸类为主.根据已发表文献挖掘广枣的主要药理活性及化学成分,应用AutoDock Vina软件将广枣活性化学成分与IL-6、AC、Thrombin进行对接,结果显示广枣的有效活性成分与上述三种蛋白均具有良好的结合活性.基于蒙医学角度及现代医学角度,综述广枣对于心血管疾病有关的药理研究,为深入探索广枣抗心血管疾病的药效物质

广枣心血管疾病作用机制化学成分分子对接

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4.目录基于最优搜索理论的分子对接研究

thesis_D663134

[硕士论文]姚辉软件工程电子科技大学2015

摘要：随着人们对健康生活方式的重视，医药行业得到了巨大的发展。在传统药物设计方法无法有效地满足行业需求的背景之下，分子对接作为一种有效地理性药物设计方法，得到了广泛地应用，成为大规模药物分子虚拟筛选的重要途径。本文围绕着分子对接的构象搜索和打分函数展开了研究。　　首先综述了计算机辅助药物设计的发展过程，分析对比了传统药物设计方法和理性药物设计方法。在深入分析了分子对接的理论基础后，阐述了分子对接在新药

分子对接免疫遗传虚拟筛选最优搜索理性药物设计

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5.分子模拟技术在食品领域中的应用研究进展

periodical_spyjj202405002

[期刊论文]毕新健文诗雨屈婷敏等-《食品与机械》CSTPCD北大核心CSCD2024年5期

摘要：从食品领域的上游实验室研发到下游工厂生产过程中,有许多问题无法用传统试验方法从宏观上得到解决.分子模拟技术不仅简洁高效、成本低廉,还可以通过对分子行为的分析快速预测或解释试验结果,是连接微观与宏观的重要工具.文章阐述了食品领域分子模拟技术的基本原理,梳理了食品领域分子模拟技术常用的数据库和软件及其特点,综述了近几年分子模拟技术在食品安全、食品加工和贮藏、食品功能因子筛选及其机制研究领域中的应用

分子模拟技术分子对接模拟分子动力学模拟食品安全食品加工与贮藏食品功能因子

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6.反向分子对接技术在中药作用靶点预测、有效成分筛选及作用机制探索中的应用

periodical_zgzyzz201723015

[期刊论文]关宏炜徐丽君董慧-《中国中药杂志》北大核心CSTPCD2017年23期

摘要：文献综述,总结反向分子对接技术应用于中药作用靶点、有效成分筛选及中药潜在作用机制探索的情况,为中药临床研究及新药研发提供更多的理论依据.

中药反向分子对接对接软件数据库

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被引：25

7.分子模拟技术在食品分子互作中的应用研究进展

periodical_spyfx202214041

[期刊论文]王娟娟李海平-《食品与发酵工业》CSTPCD北大核心2022年14期

摘要：分子模拟技术是近年来探究食品组分之间、食品组分与机体之间、食品组分与环境之间互作机理和构效关系的一种新兴技术,因其能打破科学实验存在的盲目、耗时、费力等局限性,在食品领域的应用日益广泛.该文从分子模拟的概念出发,首先介绍了分子对接、分子动力学和量子力学3种分子模拟技术的基本原理,重点综述了分子对接技术(基于AutoDock和Discovery Studio软件)、分子动力学技术(基于

分子模拟分子对接分子动力学量子力学食品分子互作

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被引：21下载：79

8.目录PD-L1小分子抑制剂的虚拟筛选及免疫抗肿瘤活性研究

thesis_D02223157

[硕士论文]王思琦药学江苏大学2020

摘要：作用和免疫激活作用的考察，最终获得了小分子PD-L1抑制剂阿尼芬净。本论文共分为以下五部分：　　1.综述　　本章围绕PD-1/PD-L1、基于计算机的药物虚拟筛选技术以及生物分子相互作用的测定方法进行综述。首先回顾了PD-1/PD-L1的功能和作用机制、PD-1/PD-L1抑制剂的国内外研究进展，然后介绍了药效团模型和分子对接等计算机虚拟筛选技术及其常用软件，以及在药物虚拟筛选中的应用，最后介绍了

PD-L1抑制剂肿瘤免疫药效团模型分子对接阿尼芬净

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下载：61

9.分子对接在中药药效物质筛选及作用机制研究中的应用进展

periodical_zgys201806017

[期刊论文]王文军丁一窦芳等-《中国药师》CSTPCD2018年6期

摘要：分子对接技术属于计算机辅助药物设计(computer-aided drug design, CADD)的一种主要方法,近年来,在筛选中药药效物质、寻找药物作用于疾病的靶点以及探索中药的作用机制被广泛运用并取得了一定进展.本文通过文献综述,介绍了分子对接的原理、分子对接机制以及部分常用的软件,并着重总结了分子对接技术在中药药效物质筛选及作用机制研究中的应用,此外对分子对接存在的问题进行讨论与展望,

分子对接药效物质筛选作用机制靶蛋白

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被引：62下载：374

10.分子对接在药物虚拟筛选中的应用进展

periodical_gzhx201706012

[期刊论文]张煜卓戚涵姝谷笑雨等-《广州化学》2017年6期

摘要：虚拟筛选是药物设计的重要手段之一,利用小分子化合物与药物靶标间的分子对接运算,研究人员可以准确地获取两者之间的相互作用情况,从候选化合物库中快速筛选出潜在的药物或药物前体,从而加速药物开发过程.介绍了虚拟筛选与分子对接的相关原理与流程,主要综述了对药物进行虚拟筛选时所涉及的分子对接技术类型、常见的分子对接软件以及分子对接典型样例.分子对接对提高虚拟筛选的效率、降低药物开发的成本具有重要的现实意义

虚拟筛选分子对接药物药物设计应用

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被引：68下载：311

11.目录锆金属有机框架磁性材料的制备及其在小分子化合物萃取中的应用

thesis_D02431015

[硕士论文]王元药物化学重庆大学2021

摘要：阐述，最后提出本论文研究的主要内容及意义。　　第二章实验制备UiO-66@PA@PEI@Fe3O4磁性吸附剂用于黄连和黄柏中小檗碱的萃取富集研究。通过优化材料合成时的反应温度、反应时间以及反应体系中甲酸的含量以确定最佳的合成条件并对材料进行表征。然后对影响小檗碱萃取和洗脱效率的因素进行优化并进行方法学验证，对材料的可重复利用性和稳定性进行了考察。同时，采用分子对接软件和吸附等温模型对材料的吸附机理

磁性材料小分子化合物样品前处理固相萃取金属有机框架吸附剂

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12.小分子化合物靶向DNA连接酶Ⅳ提高CRISPR/Cas9基因编辑效率的研究进展

periodical_hbnykx202022003

[期刊论文]肖红卫毕延震-《湖北农业科学》北大核心CSTPCD2020年22期

摘要：实现更有效的基因定点插入,综述了SCR7、NU7026、白藜芦醇、L755507这4种不同的小分子化合物在CRISPR/Cas9基因编辑效率上的研究,归纳了这4种小分子化合物在其中发挥的作用,并用生物信息学软件模拟所用小分子化合物与DNA连接酶IV的对接.在此基础上,对这4种小分子化合物提高基因编辑效率的研究前景进行了展望.

双链断裂同源重组非同源末端连接DNA连接酶IV小分子化合物

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13.酪氨酸激酶小分子抑制剂的设计、合成及抗肿瘤活性研究

thesis_Y1754637

[博士论文]孙敏制药工程东南大学2009

摘要：综述了酪氨酸激酶及其小分子抑制剂的研究进展，并对最新报道的几类酪氨酸激酶抑制剂进行定量构效关系(QSAR)研究，阐明了抑制剂产生激酶抑制活性所必需的结构特征。分别以上市的酪氨酸激酶抑制剂Sorafenib和Dasatinib作为先导物，设计合成了两大类5个系列目标化合物，并测试了这些化合物在体外的抗肿瘤增殖活性，基于活性测试的结果进行了构效关系分析和分子对接研究。具体研究内容如下：　　 1.酪氨酸

抗肿瘤药物酪氨酸激酶抑制剂药物设计化学合成定量构效关系分子对接抗肿瘤活性

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被引：1下载：887

14.目录基于组合中药分子化学设计的川芎嗪类衍生物的合成及其对胆碱酯酶抑制和细胞保护活性研究

thesis_D02181811

[硕士论文]陈旭飞中药学西北大学2020

摘要：。通过分子模拟对接，阐释活性化合物的抑制胆碱酯酶的作用机制。全文共分为以下三个部分内容，作者的主要贡献如下：　　1.对老年痴呆的现状包括中西医的发病症候、发病机制、临床用药、现阶段进展中临床实验药物情况进行系统综述。阐释组合中药分子化学研究策略在药物分子设计的重要作用。　　2.基于组合中药分子化学研究策略，以传统治疗老年痴呆的活血行气中药川芎中的活性成分川芎嗪为出发点，在其结构中引入具有益智作用的

阿尔茨海默症川芎嗪类衍生物胆碱酯酶抑制活性细胞保护组合中药分子化学

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15.目录结合电化学吸附富集的单分子检测

thesis_Y1066088

[硕士论文]田欣哲分析化学山东大学2007

摘要：第一章对单分子检测的研究现状及其发展趋势进行了综述。包括单分子检测的概况、所用的主要检测技术、方法，以及单分子检测过程中的技术关键、单分子的证明、荧光探针等内容。重点介绍了全内反射荧光显微术的成像原理及单分子检测的应用前景等。共引用文献79篇。第二章研究了R6G在ITO工作电极上的吸附特性。我们制备了ITO工作电极，对吸附的最佳条件进行了研究，并且讨论了R6G在ITO工作电极上的

单分子计数电化学吸附全内反射罗丹明6G纳米通道PDMS芯片制作

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被引：1下载：123

16.目录钴多吡啶配合物的DNA键合、光裂解及对接的理论研究

thesis_Y1692295

[博士论文]苗体方物理化学中山大学2010

摘要：理论研究。通过研究系列钴(Ⅲ)多吡啶配合物的几何结构和电子结构，解释配合物的DNA键合性质，获得其调控规律。同时，通过研究钴(Ⅲ)多吡啶配合物基态和激发态的几何结构和电子结构等方面性质，初步探讨了这些配合物的DNA光裂解机理。最后，运用对接软件Dock6.2，把钴(Ⅲ)多吡啶配合物对接到DNA碱基对中，从总体模型上，研究其配合物与DNA碱基对作用的部位、键合性质、电子结构及光谱性质等。　　本论文

钴多吡啶配合物DNA键合DNA光裂解密度泛函理论从头计算单组态相互作用DNA对接

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17.多巴胺第三受体酚类抑制剂分子设计、合成及其性质研究

thesis_Y2017766

[硕士论文]卞富永物理化学云南大学2011

摘要：多巴胺第三受体(D3R)参与调控运动功能,认知活动和药物成瘾等生理,病理过程,与药物滥用成瘾,精神分裂症以及帕金森病症等有关,是研究这些病症药物分子作用靶点。本文第一章综述了多巴胺的牛物学原理、多巴胺第三受体的研究进展和意义,介绍了药物设计的一些常用软件。　　第二章是同源模建和分予对接研究D3R蛋白结构和筛选抑制剂分子。多巴胺第三受体(D3R)蛋白是治疗多种疾病的重要靶点,由于其膜蛋白质因素

多巴胺抑制剂同源模建分子对接傅克反应

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18.目录皮肤光老化领域可视化分析及中药作用机制研究

thesis_D02439354

[硕士论文]王恒旭中西医结合临床辽宁中医药大学2021

摘要：靶点导入STRING平台构建蛋白互作（protein-proteininteractionnetwork,PPI）网络。运用R3.6.0软件对核心靶点进行GO与KEGG富集分析，并绘制前25条KEGG结果的“通路—靶点”网络图。采用Autodock_vina软件对活性成分与靶点进行分子对接验证，对接结果用Pymol显示。　　结果：　　1.该领域发文近年来出现下降，但仍然保持较高发文量;纳入研究的论文

皮肤光老化中医治疗网络药理学分子对接成纤维细胞

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被引：2下载：91

19.中医学与印度阿育吠陀防治新型冠状病毒感染的研究主题及热点比较研究

periodical_ytctyy202407002

[期刊论文]刘莹莹汪蔚青-《亚太传统医药》2024年7期

摘要：研究论文的分布情况及研究热点.结果:中医药防治新冠病毒感染研究相较于阿育吠陀相关研究发文数量更多(1 177/259)、参与国家更多(74/31)、参与机构更广(610/327).中医药防治新冠病毒感染研究主题涉及网络药理学、系统综述、血必净注射液、荟萃分析、人参皂苷、模拟研究、网络分子对接等,研究热点包括网络药理学、分子对接、植物药、系统评价、抗病毒、急性肺损伤、天然产物等.阿育吠陀防治新冠病毒

新型冠状病毒感染中医学阿育吠陀对比分析

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20.目录基于网络药理学探讨消瘿灵水丸治疗甲状腺结节的作用机制

thesis_D03135556

[硕士论文]吴阳中医内科学辽宁中医药大学2023

摘要：-有效成分-靶点的生物信息学模型；采用Metascape进行GO、KEGG富集分析；通过PDB、TCMSP数据库获取靶点和成分结构，并通过AutodockVina软件进行分子对接验证。　　结果：　　第一部分：共纳入中文文献636篇，发文量最多的作者是来自湖北省中医院的左新河(12篇)，形成了以左新河、杜丽坤、倪青等为代表的研究团队，其中湖北中医药大学为发文数量最多的科研机构（21篇）；关键词共现、

甲状腺结节中医药网络药理学消瘿灵水丸

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