成果简介：开发了Screen_miRNA软件，用于植物miRNA分子的发掘和鉴定。该软件将miRNA对应的前体序列从EST，GSS，Contig等序列中筛选出来，并根据miRNA前体二级折叠图形是否为茎环发夹结构,短读序列是否位于发夹结构的茎臂上，茎臂上短读序列与互补序列是否存在错配，以及折叠构像的最小自由能等结果综合判定短读序列是否是真正的miRNA分子，计算得到的茎环折叠发夹结构以JPG的格式保存在指定目录下。该软件对于判断短读序列是否是真正的miRNA分子具有重要价值，可为从事分子生物学、农学、生物学的科技工作者使用。Sreen_miRNA软件可快速、高效、高通量对植物的短读序列进行miRNA分子的发掘和判定。

成果简介：探索出鲍威尔脐橙、塔罗科血橙、蜜奈夏橙、奥林达夏橙等晚熟柑桔的贮藏、预冷技术参数和适宜货架期，以及主要生理代谢、品质变化规律、发病规律。研究和总结出晚熟柑桔保鲜处理、包装、打蜡技术。抑霉唑等杀菌剂处理可降低果实腐烂损失；塑料薄膜单果包装适用于鲍威尔脐橙、塔罗科血橙、蜜奈夏橙、奥林达夏橙等晚熟柑桔，可明显降低果实失重率；打蜡可改善果实外观，但果实仅能短期贮藏。对湿冷通风库进行了优化设计。研发出一种新型贮藏保鲜库-自动地下通风降温式通风库，该库不仅能地下通风、机械排风、利用自然冷源，并同时具有保温、自动控制通风降温功能；该库的自动通风系统可应用于湿冷通风库、冷库、通风库等。晚熟柑桔通过贮藏保鲜综合技术的实施，蜜奈夏橙贮藏90天，腐烂率5.46%，总糖、有机酸、维生素C的损失率分别为7.1%、16.7%、9.5%，货架期可达30天。奥林达夏橙贮藏95天腐烂率0.15%，总糖、有机酸、维生素C的损失率分别为6.3%、14.9%、5.2%，货架期可达20天。塔罗科血橙贮藏90天腐烂率4.79%，总糖、有机酸、维生素C的损失率分别为7.5%、18.6%、9.2%，货架期可达15天。鲍威尔脐橙贮藏90天，腐烂率2.53%，总糖、有机酸、维生素C的损失率分别为3.9%、20%、4.0%，货架期可达30天。编写出《晚熟柑桔冷链贮运技术规程》，并进行了技术推广应用，在奉节、江津、开县开展技术应用，指导建设制冷保鲜库3座，贮藏容量5000吨，2013年度晚熟柑桔冷链贮运营销应用量9000吨，每吨增值800元以上，合计增值960万元，经济效益显著。申报了专利１项，发表论文３篇，培养硕士研究生２名。

成果简介：一种柠檬片的制作工艺，特别涉及一种柠檬鲜片的制作工艺。柠檬富含维生素C、柠檬酸、苹果酸及钙、铁、锌等多种元素，是一种高价低钠的健康食品，具有清热、降压、滋润养颜等功效，深受大众喜爱。但柠檬鲜果因切开后易褐变、保存困难、携带不便等问题而受到季节和场所的限制，不能满足人们的需求。人们都是采用将柠檬切片后直接干燥成干柠檬片来保存，柠檬在加工成干柠檬片的的过程中，维生素C会严重损失，柠檬精油及花青素也会部分损失，虽保留了柠檬的酸味，但主要营养成分均会受到破坏。因此，寻找一种既能保存柠檬的营养成分，又不会使柠檬褐变的柠檬片的加工工艺成了业内人士追寻的目标。该项目的目的就在于提供一种一种既能保存柠檬的营养成分，又不会使柠檬褐变的柠檬片的制作工艺。该项目采用特殊工艺对鲜柠檬片进行护色处理，然后真空包装杀菌，不添加任何防腐剂。

成果简介：属于农业分子生物领域，具体的说，涉及一种同时检测柑桔4种重要嫁接传播病原的一步法多重PCR检测方法。通过对4种重要嫁接传播病原柑桔衰退病毒，柑桔裂皮病类病毒，柑桔碎叶病毒，柑桔黄龙病菌的引物优选，以及对引物浓度，PCR扩增条件等的优化，实现了同时检测柑桔4种重要嫁接传播病原。检测方法快速准确，避免了常规PCR的重复检测，检测稳定性好，特异性强，一致性高，适用于大规模推广，可以用于指导引进品种和推广苗木的无毒化，确保柑桔安全生产。

成果简介：属于昆虫饲养领域，涉及一种用于传毒分子机制研究的无毒褐色桔蚜的饲养方法，包括利用无毒柑桔苗进行继代饲养得到无毒无翅褐色桔蚜，配制饲养液与灭菌，饲养室的制备及饲养。该方法通过调整无毒柑桔苗上无翅成蚜和下一代若蚜数，有效抑制了有翅成蚜的形成，实现了周年无毒无翅成蚜的获得，保证了实验试虫的标准化。饲养液简单易于配制，实现了无翅成蚜在脱离寄主植物后得以短期正常存活，并不影响传毒效率，适用于蚜虫传播柑桔衰退病毒的分子机制研究的需求。

成果简介：该软件系统是基于柑橘园实时生态信息的旱情监测与预警软件系统，功能包括墒情实时监测与预警、旱情远程诊断、灌溉系统控制、生态信息数据历史查询等。通过该软件系统，用户根据传感器监测的空气-土壤-冠层温湿度等信息，运用建立的旱情预测模型，推衍柑橘叶片含水量，根据专家知识实现柑橘园旱情实时监测、诊断和预警，还可通过具备电子阀控制功能的水分灌溉管道系统实现水分的自动灌溉控制。

成果简介：一种信息化技术支撑的果园信息化服务车，涉及服务车技术领域。果园信息化服务车主要包括驾驶舱和与驾驶舱连接的工作车厢，在工作车厢内设有办公椅、工作台、办公设备、空调系统、供电装置和设备柜，还包括办公设备包括车载便携光谱监测装置、电脑主机、显示器和样品管理装置。该项目的有益效果在于：技术人员能到果园现场为果农进行信息化服务，主要包括在果园现场开展土壤和叶片营养诊断、果实品质分析、果园墒情和冻害等监测、病虫害识别、多媒体培训等，还能对于不能现场解决的技术问题通过摄像系统或数码照片将现场资料以网络发送给远方专家，获得专家的远程决策支持和培训指导。

成果简介：该项目属于生物技术领域，公开了一种柑桔衰退病毒的环介导逆转录等温扩增（RT-LAMP）检测方法。灵敏度比普通逆转录-聚合酶链锁反应（RT-PCR）高100倍，对病毒早期诊断准确性更高。该项目与RT-PCR方法检测结果一致，比DTBIA方法灵敏、准确。该项目方法可快速、准确、灵敏地检测柑桔衰退病毒，适合样品快速检测、CTV流行监控、脱毒苗木鉴定和衰退病毒的鉴别。该项目根据GenBank公布的柑桔衰退病毒（CTV）不同株系的基因序列，针对柑桔衰退病毒序列保守区域设计了CTV的RT-LAMP检测方法的特异性引物2对，一对外引物F3、B3和一对内引物FIP、BIP，2对引物序列。以提取样本总RNA为模板，建立了快速检测柑桔衰退病毒的RT-LAMP技术。该项目RT-LAMP检测技术利用特异引物（4条），以识别柑桔衰退病毒靶基因的几个特定区域，特异性更强。反应在等温（63℃）条件下进行，不需要循环仪等昂贵的仪器，扩增反应极快，一般35-60分钟完，扩增产物量大，利用电泳检测或荧光染料技术鉴定出待测样品中是否含有柑桔衰退病毒；灵敏度高、特异性强，适合病毒的快速准确检测。

成果简介：该软件系统主要是针对柑桔地块尺度的面向广大基层科技人员的精准施肥推荐应用系统，主要功能包括采样点的规划、养分数据管理、土壤养分分析、施肥决策、结果发布等。系统是面向SOA架构的，表示层采用FLEX4富客户端技术，后台基于Web服务方式提供施肥服务的调用。整个系统用MVC架构模式使精准施肥业务逻辑和页面展示完全分离，便于系统的后期维护和扩展。

成果简介：该标准规定了柑桔及其制品中多甲氧基黄酮(甜橙黄酮、川皮苷和蜜桔黄酮)含量的液相色谱测定方法。该标准适用于柑桔及其制品中多甲氧基黄酮(甜橙黄酮、川皮苷和蜜桔黄酮)含量的测定。该标准定量测定范围：甜橙黄酮、川皮苷和蜜桔黄酮均为0.02mg/L～30 mg/L。该标准方法定量限：甜橙黄酮、川皮苷和蜜桔黄酮均为0.02 mg/kg。该标准方法检出限：甜橙黄酮、川皮苷和蜜桔黄酮均为0.01mg/kg。测试原理：试料中的多甲氧基黄酮经甲醇超声提取、净化、微孔滤膜过滤，高效液相色谱法测定，外标法定量。标准功用：标准实施后，对确保柑桔产品的质量安全，加强柑桔产品的质量监督，促进柑桔产业的发展，增强柑桔产品在国内外市场的竞争力等均具有重要作用。

成果简介：主要技术内容：该研究以科技创新为手段，以农业产业效益提升和新兴产业培育为重点，对全市主要农产品生产成本进行比较，对各农产品效益和比较优势进行测算；在深入分析种养殖业产业发展和技术瓶颈基础上，结合产业发展趋势和市场需求，探索各产业技术发展方向，设计各产业技术需求和技术路径；筛选出先进适用技术项目，评估完成技术项目的能力，编制科技支撑重点和实施方案；结合效益农业发展要求，以农业园区建设为抓手，农业科技成果转化和科技产业示范为重点，提出发展效益农业的创新型产业模式和政策支持方式。该研究获得重庆市科学技术成果认定。技术创新点：第一、首次系统测算了重庆市主要农畜产品的生产成本，并对其效率优势、效益优势和规模优势进行了系统评估。通过对重庆市主要农作物、畜禽、水产综合优势指数测定和市场竞争力的评价，提出了应当重点发展的优势产业及优先序列。对现有农业优势产业发展评价客观、系统、深入，所提发展优势产业符合重庆实际，操作性强。第二、系统筛选了支撑重庆市效益农业发展的技术和技术路径，具有开拓性、创新性和适用性。为政府及相关科技管理部门、农业部门、农业企业等的发展提供了更为科学的决策依据。第三、研究提出了农业园区建设为抓手，带动农业科技的示范应用、推广，促进重庆市效益农业发展。第四、分类评价了农业科技政策，提出了建立重庆市农业科技成果转化、农业科技园区建设以及科技产业示范工程建设专项资金等政策建议。知识产权：出版专著1部。应用推广及效益：2012年7月6日，重庆市政府召开全市特色效益农业工作会，颁布了《重庆市人民政府关于加快发展特色效益农业的意见》，明确提出“用现代科技支撑特色效益农业发展”工作目标。2012年9月10日，在“重庆学习论坛”上，时任市委书记张德江强调，大力发展特色效益农业，加快重庆农业现代化进程。这两次会议的召开，是对研究工作的充分肯定。重庆市委、市府2013年至2015年连续3年关于农业农村工作的意见中，都明确提出“大力发展特色效益农业，促进农民收入快速增长”、“强化农业科技支撑”等工作要求。部分成果还在重庆市、区县、高校、研究院所和企业相关科技计划和产业发展中得到广泛应用，并安排特色效益农业项目资金10亿元。

成果简介：该标准在借鉴了UPOV的《特异性、一致性和稳定性测试指南柑橘》的基础上，结合中国实际情况，制定了更具全面性、实用性、代表性和可操作性的农业行业标准，该标准规定了柑橘新品种特异性、一致性和稳定性测试的技术要求和结果判定的一般原则，适用于柑橘属(Citrus L.)植物新品种的特异性、一致性和稳定性测试和结果判断。该标准于2014年1月1日开始实施，是中国实施柑橘植物新品种保护的重要测试指南和技术依据。

成果简介：该标准通过对中国柑橘主产区及其生产上主栽柑橘品种及其贮藏病害防治技术应用情况进行调研，并对调研数据进行了科学的统计分析的基础上，确定了柑橘贮藏期病害防治技术参数，起草了《柑橘贮藏期病害防治技术规范》。该标准的技术内容科学、严谨，具有较强的科学性、先进性和实用性。该标准所确定的技术内容与中国现行的有关法规和标准协调一致。标准的制定与实施，将有助规范中国柑橘采后产业技术标准化水平，有利于提升柑橘品质和市场竞争力，为柑橘产业实现可持续发展提供技术支撑。通过该标准的实施，对柑桔产区规范用药，指导柑桔贮藏期病害标准化管理，提高中国柑桔果品质量安全，以及对满足人民健康要求都具有极其重要的作用。柑桔采后处理、贮藏保鲜和物流水平的提高，对调整农业和农村经济结构，提高果品采后的附加值，实现农民增收，农业增效，促进农村经济与社会的可持续发展，建设新农村，实现农村全面建设小康社会的总体目标同样具有十分重要的战略意义。同时，对打破柑桔业发达国家绿色壁垒战略，提升中国柑桔国际竞争力，增大出口贸易都会产生巨大的社会效益和经济效益。

成果简介：该标准规定了柑桔类水果及制品中总黄酮含量的比色检测法；该标准适用于柑桔类水果及制品中总黄酮含量的测定。该标准总黄酮的定量测定范围：0.8mg/L-100mg/L；该标准总黄酮的定量限：0.8mg/kg；该标准总黄酮的检出限：0.3mg/kg。精密度与准确度：以夏橙果皮、锦橙果肉、澳柑果皮、统一鲜橙多果汁等为试材，进行了精密度与添加回收率(以同一样品作为本底添加同时)试验，实验平行11次，按该方法进行测定。结果显示：样品平均回收率为94.7%-104.5%，方法变异系数为1.31%-4.58%，即方法的回收率和精密度均较高，测定数据重现性好、准确度高。

成果简介：试料中的橙皮苷和柚皮苷经有机溶剂热提取，微孔滤膜过滤，高效液相色谱法测定，外标法定量。该标准定量测定范围：橙皮苷和柚皮苷均为1.0mg/L-200mg/L；该标准定量限：橙皮苷和柚皮苷均为1mg/kg；该标准检出限：橙皮苷和柚皮苷均为0.3mg/kg。选择柑桔样品作为空白，进行添加回收率试验。在线性范围内添加3个浓度(5μg/mL，50μg/mL和150μg/mL)，重复3次检测，测定橙皮苷和柚皮苷的含量并据此计算回收率在95.26%-106.01%，能满足柠碱的检测要求。取橙汁本底加标，按照标准文本的操作步骤测定其橙皮苷和柚皮苷的含量，每个样品重复检测至少6次，计算该方法的变异系数变异系数为0.72%-7.54%，完全能够满足橙皮苷和柚皮苷的测定研究。

成果简介：试料中的游离酚酸用有机溶剂提取，浓缩定容，微孔滤膜过滤，高效液相色谱法测定，外标法定量。该标准规定了水果及其制品中游离酚酸(包括咖啡酸、香豆酸、阿魏酸和芥子酸)含量液相色谱的测定方法；该标准适用于水果及其制品中游离酚酸(包括咖啡酸、香豆酸、阿魏酸和芥子酸)含量的测定。该标准定量测定范围：咖啡酸、香豆酸、阿魏酸和芥子酸均为1.0mg/L-200mg/L；该标准定量限：咖啡酸、香豆酸、阿魏酸和芥子酸均为1.0mg/kg；该标准检出限：咖啡酸0.6mg/kg，香豆酸0.5mg/kg，阿魏酸0.6mg/kg，芥子酸0.7mg/kg。

成果简介：该标准是根据农业部农财发[2005]58号《关于下达2005年农业行业标准制定和修订项目资金的通知》下达的任务编写的。标准项目名称为《柑桔果汁中离心果肉浆含量的测定》(项目序号275)。由中国农业科学院柑桔研究所和农业部柑桔及苗木质量监督检验测试中心负责组织调研、试验并起草制定标准。测定原理：柑桔原果汁样品经离心法处理后，以果肉浆在果汁中的体积分数表示果肉浆的含量。该标准规定了柑桔果汁中离心果肉浆含量的离心测定方法；该标准适用于柑桔果汁中离心果肉浆含量的测定。

成果简介：柑桔类水果及制品中的柠碱用有机溶剂提取，经浓缩、定容、离心、微孔滤膜过滤后，高效液相色谱法测定，外标法定量。该标准规定了柑桔类水果及其制品中柠碱含量的液相色谱测定方法；该标准适用于柑桔类水果及其制品中柠碱含量的测定。该标准定量测定范围：1.0mg/L-200mg/L；该标准定量限：0.7mg/kg；该标准检出限：0.2mg/kg。准确度：选择柑桔果皮、种子、柑桔汁作为本底，进行添加回收率试验。在线性范围内添加3个浓度(5mg/kg，50mg/kg和150mg/kg)，重复3次检测，试验结果显示其回收率范围在89.6%-104.3%之间，能满足柠碱的检测要求。以柑桔果皮、柑桔果汁、柑桔种子为试材，按照标准文本的操作步骤测定其柠碱的含量，每个样品重复检测6次，试验统计结果显示：该方法柠碱的变异系数为0.28%-1.16%，完全能够柠碱的测定研究。

成果简介：该标准规定了柑桔类水果及制品中香精油含量的蒸馏滴定测定法；该标准适用于柑桔类水果及制品中香精油含量的测定。该标准是农业部《关于下达2004年农业行业标准制定和修订项目资金的通知》(农财发[2004]56号)文件下达的第104号项目。原理：柑桔类水果及制品中的香精油经蒸馏法提取，提取液中加入盐酸和溴化盐溶液，游离出来的溴与香精油定量反应；甲基橙为指示剂，用溴化钾-溴酸钾标准溶液滴定，黄色消褪为无色即为滴定终点，根据标准溶液滴定消耗量进行定量。

成果简介：项目执行期间，项目组成员在项目负责人的统一安排和协调下分工合作，密切配合，根据项目执行过程中遇到的具体问题适时调整研究方案，经过3年的努力，发掘了大量的参与柑橘果实脱落、CTV应答反应、有机酸代谢和果皮褐变的基因，并克隆了15个参与以上反应的基因全长，初步鉴定了8个基因，为进一步获得具有自主知识产权的基因奠定了基础。同时还建立了DNA实物保存库和数据库各1个。该项目圆满完成了项目任务书要求的各项研究任务，达到了项目合同规定的各项指标。基因的发掘、克隆与鉴定2007-2008年分别构建了果实褐变和有机酸代谢的抑制性差减文库，采用RACE技术克隆了钙调蛋白基因CsCAB、柑桔NAC结构域蛋白基因CsNAC和柠檬酸合成酶基因CsCS的全长，并构建了植物表达载体，通过转化烟草研究其功能，检测了其在柑桔不同组织中的表达水平，明确其对果实发育与衰老以及有机酸代谢的调控作用；同时还研究了采后钙处理对奉节脐橙果皮褐变及贮藏品质的影响。2008-2009年采用基因芯片技术获得了1245个在乙烯处理柑桔果实和CTV侵染柑桔植株后差异表达的基因，并采用荧光定量RT-PCR技术随机挑选了25条基因对芯片数据进行了验证，结果表明荧光定量RT-PCR验证的基因表达变化趋势与基因芯片的变化趋势是一致的，说明基因芯片数据可靠；采用RACE技术和电子PCR技术克隆了一些参与果实脱落和CTV应答反应的重要基因，如乙烯诱导的脂酶基因(EIE),伤害诱导蛋白基因(CsWIP1-4),乙烯响应转录因子(TERF)等。DNA实物保存库和数据库的建立构建了DNA实物保存库和数据库各一个,并探索出一套对DNA实物保存库进行繁殖、继代和长期保存的方法；DNA数据库已经收录了该实验室获得的2075条EST序列，并能进行简单的查询和检索服务。